Puerto Rico 1897 speelt zich af in het jaar nadat Puerto Rico politieke autonomie verkreeg en zich losmaakte van de koloniale Spaanse regering. In het spel neem je de rol aan van een onafhankelijke Puerto Ricaanse boer in dit nieuwe tijdperk en neem je het op tegen anderen om arbeiders in te huren voor het verbouwen, verkopen en verhandelen van waardevolle gewassen. Je hebt ook de leiding over de wederopbouw van delen van het land, terwijl je probeert vitale stadsinfrastructuur aan te leggen. Je doel gedurende het spel is om meer rijkdom en aanzien te verwerven dan je tegenstanders en de meest welvarende boer in het hele land te worden.